植物では、一方の親の遺伝子がもう一方の親の遺伝子とは異なる発現特性を持つゲノムインプリンティングが発生します。植物の進化と植物育種における雑種の重要性により、これは潜在的に重大な結果をもたらし、遺伝的変異を何世代にもわたって隠すことができるメカニズムを提供します。核構成の研究では、染色体とゲノムの位置が F1 雑種におけるインプリンティングに関連しており、周辺ゲノムが優先的に発現される傾向があることが示されています。ライコムギ（小麦とライ麦の雑種）などの一部の近交系倍数体雑種では、脱メチル化剤アザシチジンによる処理により隠れた変異が解放されますが、これはおそらくインプリンティング現象によって失われたものと考えられます。