応用微生物学: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

膣内微生物叢とHPV感染患者の表現型との機能的関連性に関するメタゲノミクスに基づく研究

Qi Chen1, Jhih-Hua Jhong, Shangfu Li, Chien-Hsun Huang*, Tzong-Yi Lee

目的：本研究では、膣マイクロバイオームの複雑かつ可変的な生態に焦点を当て、表現型間の関連性を解明します。

方法と結果: 39人の台湾人女性を対象とした研究では、16S rRNA配列データを使用した微生物の存在量に基づく初期の教師なしクラスタリング分析によって、4つの微生物群集タイプが特定されました。これらの群集タイプ間で種の多様性が異なり、それが主に均一性に反映されていることがわかりました (p<0.001)。他の群集タイプと比較して、均一性の低いグループは、ラクトバチルスの相対的存在量が高く、ヒトパピローマウイルス (HPV) 感染が高く、子宮頸部上皮内腫瘍形成および扁平上皮内病変がより重篤でした。ガードネレラと連鎖球菌が優勢な他のグループでは、ガードネレラがASC-USからCIN2およびHSILへと重症度とともに徐々に減少していることがわかりました。推定メタゲノムからの機能分析では、均一性の低いグループがDNA修復、組み換えタンパク質、DNA複製タンパク質、およびピリミジンやアミノ糖、ヌクレオチドなどのDNA活性を含むいくつかの経路を示していることが示されました。高均一性グループではアミノ酸代謝と生合成が強化されていました。

結論: 私たちの研究結果によると、種の均一性は膣内微生物叢において重要な役割を果たし、膣疾患の影響の根底にある機能経路の変化につながる可能性があることが強調されました。

研究の意義と影響: この研究は、生態学的バランス、特に種の均等性が膣内微生物叢を形作る可能性があることを明らかにしています。