人類学
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概要

食道癌患者の予後を予測する新しいカップトーシス関連LncRNAシグネチャー

Shang Peng, Haipeng Li, Jingting Min, Ran An, Nana Du1, Zhenghong Li*

はじめに:食道がん (ESCA) は、世界中で腫瘍関連死亡の大きな原因となっています。カップロプトーシスは、フェロプトーシス、ピロプトーシス、アポトーシスなど、他の制御細胞死とは異なる新しい細胞死です。しかし、ESCA の開始と進行におけるカップロプトーシスの役割は不明のままです。

材料と方法:癌ゲノムアトラス (TCGA) データベースの食道癌患者 173 名のトランスクリプトームデータと臨床データを Perl ソフトウェアで分類および抽出しました。ピアソン相関分析を、カップロプトーシス関連遺伝子とすべての LncRNA に対して実行しました。予後関連 LncRNA は、単変量および多変量 Cox 回帰分析によって決定され、各患者のリスクスコアを計算するための新しい予後モデルが構築されました。C 指数曲線、主成分分析 (PCA) 分析、受信者動作特性 (ROC) 曲線分析を使用して、3-カップロプトーシス関連 LncRNA (CRL) モデルの予後予測性能を評価しました。さらに、多変量 Cox 分析を使用して、コホート全体およびさまざまなサブグループでのモデルの予後価値を評価しました。

結果と考察: EWSAT1、AC125437.1、GK-IT1を含む3-CRLリスクスコアリング基準は、ESCAの全生存率（OS）を評価するために確立されました。生存分析とROC曲線は、スコアがTCGAトレイングループとテストグループで優れた予測性能を示したことを示しました。各LncRNAの係数はLasso回帰を使用して分析され、ラムダ値が決定されました。主成分分析を使用して、3-CRLが高リスクサンプルと低リスクサンプル間のギャップを明確に区別できるかどうかを判断しました。多変量Cox回帰により、3-CRL特性がOSの独立した予後因子であることが示されました。ノーマンマップは予後予測において堅牢な有効性を示しました。

結論: 3-CRL に基づくリスク特性は、食道癌患者の予後を予測するために使用できる可能性がある。