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概要

Une nouvelle signature pronostique immunitaire liée au gène CCR7 pour le carcinome hépatocellulaire du foie (LIHC) basée sur le profilage immunogénomique

Xinhui Wang*, Baolin Zhou, Lei Qin, Jun Kuai, Fang Yang, Lu Yang, Lanfang Zhang, Peisheng Sun, Guangpeng Li

Objet : Explorer la fonction spécifique de CCR7 dans le mécanisme immunitaire du LIHC et construire une signature pronostique immunitaire (IPS) liée à CCR7 pour les patients atteints de LIHC.

Méthodes : Les données RNA-seq de LIHC ont été téléchargées à partir de l'ensemble de données TCGA et les échantillons ont été divisés en groupes CCR7 _H et CCR7 _L. Ensuite, une analyse ssGSEA, une analyse du microenvironnement immunitaire, une analyse du niveau d'expression des gènes HLA et des gènes des points de contrôle ont été réalisées. Les gènes immunitaires à expression différentielle (DEIG) ont été réalisés et LASSO Cox a été appliqué pour construire des IPS liés à CCR7 . Un nouveau nomogramme a été construit pour prédire le taux de survie des patients LIHC.

Résultats : Le score immunitaire, le score stromal et le score ESTAMATE sont plus élevés dans le groupe CCR_H, tandis que la pureté tumorale est plus élevée dans le groupe CCR_L . Dans le groupe CCR7_H , les gènes HLA et les gènes des points de contrôle immunitaires ont des niveaux d'expression plus élevés. Les groupes CCR7_H ont un pronostic favorable que le groupe CCR7_L . 903 DEIG ont été identifiés. Les DEIG sont principalement enrichis en activation du complément, réponse immunitaire adaptative, activation des cellules T, différenciation des lymphocytes et interaction cytokine-récepteur des cytokines. L'IPS se compose de 10 gènes, dont GHV4-59, SCML4, AKR1B10, LINC00426, TRGC1, F2RL2, TRBV10-3, SAMD9L, SLC4A10 et ROR2 . L'analyse de Cox univariée et multivariée a montré que l'IPS était un facteur pronostique indépendant de LIHC.

Conclusion : L' IPS et le nomogramme liés au CCR7 ont été construits et fournis aux patients atteints de LIHC pour prédire le taux de survie. Cette étude a fourni une nouvelle façon d'analyser l'effet pronostique de l'expression du CCR7 du point de vue de l'immunologie.