理論および計算科学ジャーナル
オープンアクセス

概要

タンパク質配列に基づくB因子の予測に関する研究

Runyu Jing、Yuelong Wang、Yiming Wu、Yongpan Hua、Xu Dai1、Menglong Li

B 因子は、デバイ・ワラー因子または温度因子とも呼ばれ、タンパク質の柔軟性の記述子であり、PDB (Protein Data Bank) 形式のファイルでよく使用されます。B 因子は、X 線散乱によってタンパク質結晶から測定できますが、タンパク質配列から直接取得することはできません。したがって、タンパク質配列のみに基づいて B 因子を予測すると、関連する研究者に何らかの参考資料を提供できます。この研究では、タンパク質配列に基づいて B 因子を予測します。AAindex の情報と予測されたタンパク質の二次構造、相対的アクセシビリティ、無秩序性、エネルギー変化を使用して、アミノ酸残基を記述します。モデリングと予測には、4 つの機械学習手法を使用します。5 倍交差検証を使用して、モデリングのパフォーマンスを評価します。その結果、この研究は、タンパク質配列に基づいて B 因子を予測および分析するためのいくつかの新しい方法を提供し、この研究が関連する研究に役立つことを願っています。