アルコール依存症と薬物依存のジャーナル
オープンアクセス

概要

ゲノム時代における食品媒介微生物の検出と追跡のためのマイクロアレイユーティリティの進歩

Baoguang Li、Isha R Patel、Ben D Tall、Christopher A Elkins

食中毒微生物による感染症の発生は、世界中で深刻な公衆衛生および食品安全上の懸念を引き起こしています。食品、水、その他の環境でこれらの病原体を検出および追跡するための、迅速で感度が高く、処理能力の高い方法が強く求められています。最近の DNA ゲノム技術の進歩により、菌株の全ゲノム内容を取得し、同時に比較系統樹を作成することで、菌株の高スループット分析が可能になりました。マイクロアレイは、1 回の実験で数百の食中毒分離株の遺伝子や遺伝形質などのゲノム DNA 配列情報を大量に抽出するのに特に適しています。したがって、過去 20 年間で、数千の完全およびドラフト微生物ゲノムへのアクセスによりマイクロアレイ技術は飛躍的に進歩し、この進歩により、現在では 1 塩基多型に至るまで遺伝子配列の変異を識別できる新しいマイクロアレイの設計と製造につながっています。DNA マイクロアレイは、食中毒微生物の迅速かつ精密なゲノム分析に依然として役立つツールです。このレビューでは、この技術を使用した当社の直接的な経験に基づいて、病原体の検出、血清型の特定、それぞれの食中毒菌株の遺伝的多様性と汚染源の追跡について主に議論します。