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概要

COVID-19患者の末梢血単核細胞（PBMC）に豊富に含まれるがん関連遺伝子：バイオインフォマティクス研究

Maryam Izad1*, Ehsan Ahmadi1, Mostafa Changaei1, Alireza Teymouri2, Behruz Alipour3

背景：過去10年間で、COVID-19は医療システムにとって最大の課題の1つとなっています。SARS-CoV-2は主に肺に影響を及ぼしますが、多くの研究では、脳障害、心不全、腎機能障害などの他の健康合併症もSARS-CoV-2感染に関連していることが示唆されています。多くの科学的努力により、SARS-CoV-2の病因の臨床的および分子的詳細が明らかにされています。しかし、COVID-19の合併症を理解するには、さらなる調査が必要です。この文脈では、SARS-CoV-2感染とがんの関係はあまり取り上げられていません。この点で、私たちはバイオインフォマティクス研究でSARS-CoV-2感染とがんの発症との間の可能性のあるリンクを発見することを目的としました。

方法:関連するデータセットはGEOデータベースから選択されました。COVID-19で、|Log2 FC|> 1およびP<0.05が統計的に有意であると見なされた差次的発現遺伝子を検索しました。Cluster Profilerパッケージは、一般的な遺伝子の遺伝子オントロジーとパスウェイエンリッチメント解析を採用しました。タンパク質の機能的相互作用はSTRINGオンラインを使用して予測され、次にCytoscape解析を実行してターゲット遺伝子を決定しました。最後に、候補遺伝子とさまざまな種類の癌との相関関係を見つけるために、遺伝子セットエンリッチメント解析を実行しました。

結果: 分析の結果、SARS-CoV-2 に感染した患者では、特に細胞周期の制御に関与する遺伝子や細胞老化プロセスに関与する遺伝子など、多数のがん関連遺伝子が上方制御されていることがわかりました。

結論:私たちの研究結果は、SARS-CoV-2 が癌を発症する確率を高める潜在的な危険因子であると考えられることを示唆しています。