応用微生物学: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

Mycobacterium simiae複合体の新メンバーであるMycobacterium cambodiensis sp. nov.の臨床株の説明

ファタハ タゼラート、ジャマル サード、ムリエル ミリテロ、ソフィー アレクサンドラ バロン、ミシェル ドランクール*、シルヴァン ゴドルイユ*

臨床的に結核が疑われる 25 歳のカンボジア人男性患者から気管支鏡検査により気管支肺胞洗浄液サンプルを採取し、Löwenstein-Jensen 培地に接種しました。急速に増殖する非色素性グラム陽性抗酸菌のコロニーを調査しました。走査型電子顕微鏡検査では、長さ 1.2 ± 0.29 μm、大きさ 0.58 ± 0.07 μm の桿菌が示されましたが、これは通常のマトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析法や表現型検査 (API ^® ZYM、API ^® Coryne、Biolog ^® Phenotype MicroArray アッセイ) では同定できませんでした。in vitro では、分離株はイソニアジド、アミカシン、トリメトプリム-スルファメトキサゾールに感受性でした。全ゲノム配列解析により、5,703,981 bp のドラフトゲノムが得られ、GC 含量は 69.3%、コーディングタンパク質遺伝子は 5,207、予測 RNA 遺伝子は 3 個 (rRNA) でした。rpoB 配列は、Mycobacterium simiae 複合体の Mycobacterium parascrofulaceum と 93% の配列類似性を示しました。ゲノム配列由来の DNA-DNA ハイブリダイゼーション、OrthoANI、および全ゲノム解析により、この分離株は M. simiae 複合体内の未記載種であることが確認されました。この種は分離元にちなんで Mycobacterium cambodiensis と命名されました。分離株は、Collection de Souches de l'Unité des Rickettsies (CSUR) に CSURP9652 の番号で寄託されました。