抗ウイルス薬および抗レトロウイルス薬ジャーナル
オープンアクセス

概要

リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応による新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の検出、中国、2020年

Huahua Feng、Honglong Wu、Huagui Wang、Jianying Yuan、Lu Chen、Hui Jin、Lingling Yang、Jinyin Zhao*、Licheng Liu*、Weijun Chen*

背景: 2019 年 12 月下旬に武漢市で原因不明の肺炎が発生した際、この流行の原因として SARS-CoV-2 と呼ばれる新しいコロナウイルスが特定されました。

方法：ウイルスゲノムのorf1ab遺伝子を標的とするリアルタイムポリメラーゼ連鎖反応が確立され、SARS-CoV-2を検出および識別することができました。このアッセイを使用して、武漢でSARS-CoV-2感染が疑われる人から採取した309のサンプルをスクリーニングしました。その結果、6つの近縁系統コロナウイルスと肺炎を引き起こす可能性のある7つのウイルスが検出されました。さらに、他のウイルスに感染した57の臨床サンプルと77の健康サンプルも検査されました。

結果：この検査の検出限界は、in vitroで転写されたcRNAの検出において、反応あたり6.25コピーであった。SARS-CoV-2感染が疑われる人の咽頭および糞便スワブの検出結果では、症状発症後最初の15日間は咽頭スワブの方が糞便スワブよりも感度が高かったが（咽頭：56.80％、糞便：30.43％）、15日後には状況が逆転した（咽頭：20.83％、糞便：27.58％）。また、マッチドペアテストでは、患者の痰サンプルの方が咽頭スワブよりもウイルス量が多かったことが示唆された（P<0.05）。他の6つのコロナウイルス（ヒトコロナウイルス229E、NL63、OC43、HKU1、SARS-CoV、MERS-CoV）と他の7つのウイルス（インフルエンザウイルスA H1N1、インフルエンザウイルスA H3N2、インフルエンザウイルスB、パラインフルエンザウイルス1、2、3、RSウイルス）の不活性培養を検出した際に交差反応は見られませんでした。さらに、ヒトコロナウイルス229E、OC43、HKU1、またはヒトアデノウイルス7に感染した肺炎患者のBALFサンプル27個、H1N1に感染した患者の咽頭スワブ30個、および健康な人の咽頭スワブ77個がこの検査で陰性でした。

結論:結果は、この検査が SARS-CoV-2 を特異的かつ高感度に検出したことを示しました。