アルコール依存症と薬物依存のジャーナル
オープンアクセス

概要

抗原回収技術はホルマリン固定パラフィン包埋組織からの DNA 収量を向上させるか?

スバッシュ・ゴベンダーとリチャード・ナイドゥー

この研究では、さまざまな pH の異なる回収溶液を用いた圧力調理の使用を調査し、ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) 組織から高品質の DNA を抽出するための最適なプロトコルを決定しました。さらに、組織ブロックの年齢に関連したアーカイブされた FFPE 組織への酸化の影響も調査しました。この研究の主な目的は、11 の胃がんに対してこの技術を調査することでした。私たちの研究のデザインは、FFPE 組織から抽出された DNA の品質を向上させるために従来の圧力鍋を使用する抗原回収技術の原理に基づいています。胃がんに加えて、リンパ腫、乳がん、前立腺がん、および結腸直腸がんを使用して、組織の偏りを排除しました。統計的相関は、対応のある t 検定と Benjamini-Hochberg 検定を使用して行われました。私たちの研究結果は、この手順にかけられなかったコントロール サンプルと比較して、圧力調理を伴うさまざまな回収溶液を使用することで高い DNA 濃度が得られたことを示しています。試験したすべての溶液で平均 DNA 濃度が増加しましたが、使用した 4 つの抗原回収溶液のうち 3 つで DNA 収量が著しく高くなりました。圧力調理によってもたらされる高圧および高温での抗原回収溶液の使用により、FFPE 組織におけるホルマリンの架橋効果を逆転させることができる可能性があります。さらに、最近処理されたブロックから抽出された DNA は、古い組織ブロックと比較して優れた収量であったという観察結果は、酸化が DNA に劣化効果をもたらすことを裏付けています。