抗ウイルス薬および抗レトロウイルス薬ジャーナル
オープンアクセス

概要

治療未経験の中央アフリカの患者から採取したB型肝炎ウイルス遺伝子型E株のコンピューター解析により、全ゲノムにおける重要な変異が明らかになった

ジスカール ウィルフリード・コヤウェダ、ロザリン・マチャリア、ジュリエット・ローズ・オンガス、ユーニス・マチュカ、ロジェ・ペレ、ナルシス・パトリス・コマス*

背景: B 型肝炎ウイルス (HBV) は、現在実施されている予防および治療対策にもかかわらず、依然として深刻な健康問題です。中央アフリカ共和国 (CAR) で流行している株の分子特性に関するデータはほとんどありません。ここでは、CAR 患者から分離された HBV の完全長ゲノムの配列を決定しました。

方法:血清サンプルはバンギのパスツール研究所で収集されました。全長ウイルスゲノムは、4 つの重複プライマーを使用したサンガー法を使用して分離され、配列決定されました。配列は、バイオインフォマティクス ツールを使用して、突然変異と薬剤耐性についてコンピューターで分析されました。

結果: 4 つの完全長 HBV ゲノムの配列解析に成功しました。4 つの分離株はすべて遺伝子型 E に属し、逆転写酵素 (RT) 機能ドメイン A に rtI90L 変異が含まれていました。1 つの分離株は S-ORF の 3' 末端にナンセンス変異を持ち、未熟な終止コドンと、3 つの表面タンパク質 (大、中、小表面抗原) すべてに対する短いタンパク質配列の生成につながっていました。コンピューター解析により、この同じ変異分離株は RT 機能ドメイン D に rtH234N 変異も持ち、結合エネルギーが増加し、アデホビルとテノホビルに対する親和性が低下することが示されました。

結論: B 型肝炎の E 型遺伝子は、中央アジアで流行している主要な遺伝子型です。中央アジア HBV 株の RT 遺伝子に変異が見つかり、この変異は薬剤耐性と関連している可能性があります。したがって、中央アジアで流行している HBV 株の HBV RT について、さらに詳細な調査が必要です。