理論および計算科学ジャーナル
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概要

糖尿病と相関するCKD発現データのインシリコベース解析によりバイオマーカー遺伝子が明らかに

モフド。ムルシャド・アーメッド、サフィア・タジーン、アフタブ・アラム、アナム・ファルーキ、シャナワズ・アリ、MD・ズベア・マリク、ロマーナ・イシュラット

慢性腎臓病（CKD）は、世界中で広範な公衆衛生問題になりつつあります。現在の疾患の不安は、根本的な病原性の変化によるものと考えられます。本研究の目的は、糖尿病と相関するCKDのマイクロアレイ遺伝子発現データの詳細な分析とバイオマーカー遺伝子の特定を提供することです。ここでは、Affymetrix発現アレイを使用して、それぞれ22のCKDと69の糖尿病サンプルで差次的に発現した遺伝子を特定しました。また、CKD状態で観察される主要な生物学的変化のいくつかを概説し、GEOデータセット（GSE70528、GSE11045）を使用してAffymetrix遺伝子チップの品質評価を実施するための具体的な手順を示し、詳細な分析の視覚化を示す品質管理パッケージも示しています。CKDで912の差次的に発現する遺伝子、糖尿病で629の差次的に発現する遺伝子を特定しました。CKDと糖尿病を広範囲に比較した結果、80の共通遺伝子が見つかり、そのうち29はアップレギュレーション、51はダウンレギュレーションされていました。さらに、これら 80 個の遺伝子を NCG で分析したところ、さまざまな種類の癌に関与する 10 個の共通遺伝子が見つかりました。したがって、この結果は、これら 10 個の共通差次的発現遺伝子を、糖尿病、CKD、癌の 3 つの病態のバイオマーカーとして考える上での重要性を強調しています。私たちの研究では、CKD の病因に重要な役割を果たし、バイオマーカーとして役立つ可能性がある差次的発現遺伝子をカタログ化しました。