抗ウイルス薬および抗レトロウイルス薬ジャーナル
オープンアクセス

概要

臨床現場におけるC型肝炎の経口直接作用型抗ウイルス療法の耐性関連変異の進化

アレッシア・ライ、ラウラ・ミラッツォ、アナリーザ・ベルニャ、マウリツィオ・ポラーノ、フランチェスカ・ビンダ、マルコ・フランゼッティ、ヴァレリア・ミケーリ、パオラ・ロンツィ、ジャングリエルモ・ゼヘンダー、サルヴァトーレ・ソッリマ、マッシモ・ガリ、クラウディア・バロッタ

C型肝炎ウイルス（HCV）は多様性に富んでいるため、異なる遺伝子型における直接作用型抗ウイルス薬（DAA）に対する耐性関連変異（RAV）の進化を生体内で
特徴付けることが重要であると考えられる。DAAレジメンを開始したHCV感染患者74名を対象に、次世代シーケンシング（NGS）により、NS3-、NS5A-、およびNS5B-HCV置換を調べた。頻度1%および15%のRAVを分析した。
全体で、43名、15名、12名、および4名の患者が、それぞれサブタイプ1a、1b、遺伝子型4、およびサブタイプ3aに感染していた。患者の大多数（64.8%）は肝硬変を患い、70.3%はHIVに重複感染し、14.9%はDAAを経験していた。ベースラインでの RAV の全体的な有病率は、当時入手可能な NS3、NS5B、NS5A 阻害剤に対してそれぞれ 74.3%、52.2%、45.9%、36.8% であったが、進行中のレジメンに関連する変異のみを考慮すると、それぞれ 39.2%、26.1%、22.8%、16.2% に低下した。変異の割合が最も高かったのはサブタイプ 1a (81.4%、p=.026) で、特に NS3 領域 (76.9%、p<.001) で多かった。治療失敗患者 7 人のうち、57.1% はベースライン配列で多数派種として置換を示していた。ウイルス再発時には、2 人の患者で、ベースラインでは少数派変異体としても欠落していた RAV がさらに蓄積していた。
患者のほぼ半数がベースラインで自然置換を示していたが、これらの置換によって DAA に対する耐性が誘発されることはなかった。少数種の検出では失敗時の耐性変異体の選択を予測できないと思われるため、本研究ではカットオフが低い NGS の役割は限られていることが示唆されました。治療前の RAV が DAA による持続的なウイルス学的反応の達成に与える影響は限られています。