人類学
オープンアクセス

概要

肺がんに関連する4つ以下の重要な遺伝子の機能的影響と、新しい機械学習分類器によって検出された新しいサブタイプ

張正俊

肺がんと生物学的に直接的または間接的に関連する遺伝子を見つけることは大きな注目を集めており、肺がんに直接関連する遺伝子が多数報告されている。しかし、公開されている「キー」遺伝子が本当に肺がん形成に重要であるかどうかは確認されておらず、有用な情報は非常に限られている可能性がある。その結果、必須遺伝子を見つけることは、肺がん研究の困難な問題のままである。最近開発された差次的発現遺伝子検出における競合線形因子分析法を使用して、肺がんの重要遺伝子検出の研究を均一な情報レベルにまで進めている。肺腺がん (LUAD) の研究 1 件と扁平上皮肺がん (LUSC) の研究 1 件 (20429 個の遺伝子、それぞれ 576 個と 552 個のサンプルを持つ 2 つの北米コホート) において、腫瘍サンプルと非腫瘍サンプルで 100% の感度と 100% の特異度で、共通する 4 つの遺伝子のセットとその機能効果が差次的に発現していることが検出されている。 2 つの追加解析でも、非小細胞肺がん (NSCLC、20356 個の遺伝子と 156 個のサンプルを持つヨーロッパのコホート) の 1 つの研究で感度 97.8%、特異度 100% の精度が得られ、ALK 陽性で EGFR/KRAS/ALK 陰性の肺腺がん (LUAD、20356 個の遺伝子と 224 個のサンプルを持つ日本のコホート) の 1 つの研究で感度 100%、特異度 95% (非腫瘍サンプル 20 個中 1 個) の精度が得られました。2 つの北米コホートと 1 つの欧州コホートの間、および北米コホートと日本のコホートの間では、4 つの遺伝子の各セット内に共通する遺伝子がいくつかありますが、機能的影響は異なります。これらの結果は、4 つの遺伝子に基づく分類器が、さまざまな種類の肺がんやさまざまな人種コホートに対して堅牢で正確であることを示しています。 4 つの遺伝子の機能的効果は、LUAD と LUSC の間の他のメカニズム (謎) を著しく明らかにします。これら 4 つの遺伝子のセットとその機能的効果は、肺がんの研究と実践に不可欠であると考えられています。これらの遺伝子の機能的効果により、患者は自然に異なるグループ (7 つ以上のサブタイプ) に分類されます。サブタイプ情報は、個別化治療に役立ちます。新しい発見は、命を救い、人々を守り、研究と肺がん治療における莫大な経済的コストを削減するために、より焦点を絞った、よりターゲットを絞った方向への新しい肺がん研究を促す可能性があります。