トランスクリプトミクス: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

インターシンプルシーケンスリピート（ISSR）を使用したキュウリの遺伝的多様性

シン DK、ラジャニ テワリ、シン NK、シャシャンク S シン

キュウリは世界中で栽培されている重要な野菜作物です。11 種類のキュウリ遺伝子型、すなわち PCUCP-2、PCUCP-3、Nun-3139、Nun-3121、Nun-3141、Infinity、Isatis、Kian および PCUC-8、PCUC-15、PCUC-28 間の遺伝的多様性と類似性を、パントナガールの GB Pant 農工大学の温室条件下で栽培しました。各遺伝子型から新鮮で若い葉を収集しました。葉を細かく切り、液体窒素を使用して粉末に粉砕しました。次に、ゲノム DNA を改良 CTAB 法を使用して分離しました。遺伝的多様性と類似性は、8 つの ISSR マーカーを使用して推定しました。6 つの ISSR プライマーから、合計 49 個の多型対立遺伝子が生成されました。ISSR データに基づいて、デンドログラムにより遺伝子型を 2 つの主要クラスターと 5 つのサブクラスターにクラスター化しました。すべての遺伝子型において、合計 40～100% の多型性が観察されました。異なるプライマーによって生成された対立遺伝子の数は 5～14 で、プライマーあたり平均 9.5 対立遺伝子であり、多型性のレベルは 88.88% でした。類似性の値は 35%～96% でした。3 つの単為結果遺伝子型、すなわち PCUC-8、PCUC-15、および PCUC-28 (Pant Khira-1) は、96% の類似性で 1 つのクラスターにグループ化されましたが、単為結果遺伝子型は別のクラスターにグループ化されました。したがって、単為結果および単為結果キュウリ間の特性評価と多様性の決定は完了しており、この情報はキュウリの効率的な育種プログラムの策定に利用できると結論付けられます。