地理ジャーナルと自然災害
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概要

ランダム増幅多型DNA（RAPD）とマイクロサテライトDNAを用いたナイジェリアの養殖および野生のClarias gariepinus（Burchell、1822）の遺伝的多様性

Michael O Awodiran* and Olumide Afolabi

Chi Farm（アジャンラ）の養殖個体群とAsejire Reservoir（アセジレ）の野生個体群のClarias gariepinusの個体群構造と遺伝的多様性を、ランダム増幅多型DNA（RAPD）とマイクロサテライトDNAマーカーを使用して分析しました。CTABプロトコルを使用して、各個体群から収集された生きた標本のサンプル20の尾びれからゲノムDNAを抽出しました。7つのRAPDプライマーと7対のマイクロサテライトDNAプライマーを使用して、抽出されたゲノムDNAのさまざまな遺伝子座をポリメラーゼ連鎖反応によって増幅し、結果として得られたDNA断片をアガロースゲルで分析しました。RAPDプライマーは、研究した7つのプライマーのすべてのサンプルで697のバンドを持つ合計474の遺伝子座を増幅しました。チ農場の養殖集団は合計 366 本のバンドを示し、アセジレ貯水池の野生集団は 331 本のバンドを示しました。養殖集団は負の近交係数 (F) -0.173 ± 0.209 を示し、これは統計的に過剰なヘテロ接合性を示していますが、野生集団では正ですが低い近交係数 0.042 ± 0.243 が推定されました。両方の遺伝子マーカーの分子分散分析 (AMOVA) は、2 つの集団間で有意差 (p=0.01) を示しました。研究の結果は、遺伝的変異性の喪失または進行中の喪失を示唆しており、研究対象の 2 つの集団で保全介入が必要です。