抗酸菌症
オープンアクセス

概要

オーストラリアのSLE患者コホートにおけるDNASE I遺伝子座の遺伝的変異

オードリー・A・マージェリー・ミュア、ジョン・D・ウェザラル、デイビッド・M・グロス

目的: DNASE I 血清濃度と活性、および配列変異は、全身性エリテマトーデス (SLE) の病理に関係していると考えられています。この研究は、SLE 患者と対照群のコホートにおける血清 DNASE I 濃度を評価し、DNASE I 配列変異を評価するために実施されました。

方法:血清中の DNASE I 濃度を 56 人の SLE 患者と、年齢と性別を一致させた 33 人の対照群で測定した。すべての SLE 患者と対照群について、DNASE I 遺伝子座位のエキソミック対立遺伝子と、イントロン 4 (VNTR - HumDN1) に存在する可変数のタンデムリピート対立遺伝子の遺伝子型を調べた。

結果:歪んだ DNASE I タンパク質濃度分布が観察され、SLE 患者の平均値は 44.2 U/mL であったのに対し、対照群 (NS) では 56.4 U/mL であった。DNASE I タンパク質が陰性であったサンプルはなかった。以前に報告された 6 つのエキソミック アレル (DNASE*1、DNASE*2) のうち 2 つだけが、4 つの VNTR アレル (3 ～ 6 回の繰り返し) とともに特定された。両方の遺伝子座はハーディ・ワインベルグ平衡を示した。エキソミック アレルと VNTR アレル、特に DNASE I* と 4 回の繰り返し VNTR (HumDN1) アレルの間で連鎖不平衡が観察された。DNASE I 濃度と遺伝子型の間には有意な関連は観察されなかった。ハプロタイプ頻度の推定では、SLE コホートとコントロール コホートの両方で同様の分布が示されましたが、DNASE*2 を含むハプロタイプでは、DNASE*1 よりも長い VNTR アレルの頻度が高くなっていることが確認されました。

DNASE I のエキソミック対立遺伝子頻度のメタスタディでは、他の集団で得られた頻度と同様の頻度が示されました。VNTR 遺伝子座については、より長い対立遺伝子 (5 回および 6 回の繰り返し) の頻度が高くなりましたが、SLE 患者と対照群の間には違いはありませんでした。

結論:この研究は、特定の 2 つの遺伝子座 DNASE I 遺伝子型が西オーストラリアのコホートにおける SLE の素因となるという仮説を支持するものではありません。