アルコール依存症と薬物依存のジャーナル
オープンアクセス

概要

ゲノムデータベースとソフトウェア: バイオインフォマティクスによる生物学的関連性の追求

マヒマ・カウシク、スワティ・マヘンドゥル、モハン・クマール、スワティ・チャウダリー、シュリカント・ククレティ

ヒトゲノムプロジェクトの完了により、細胞生物学や分子生物学に関連するさまざまな未解決の疑問を探るための膨大な情報が利用可能になりました。バイオインフォマティクスは、この情報を使用して、ゲノム全体の遺伝的、表現型的、構造的、機能的側面を解明するのに役立っています。ゲノミクスとプロテオミクスは、計算分析、解釈、およびモデリングソフトウェアの進歩により、最も関連性の高い分野の1つになりました。ゲノムとプロテオーム全体のヌクレオチドとアミノ酸の位置をそれぞれ非常に明確に説明できるだけでなく、系統解析、関連する転写因子の検索、複数の配列アラインメント、およびその他の多くの関連する探索/ハントにも役立ちます。分子生物学とバイオインフォマティクスから得られた遺伝学の知識の進歩は応用され、ゲノム編集などの潜在的な治療戦略を示しています。このレビューの目的は、DNA配列の位置、疾患に関連する一塩基多型（SNP）、転写因子結合部位上またはその近傍の配列を調査し、その後この配列と他の生物との多重配列アラインメントを行うために利用されているバイオインフォマティクスデータベースとソフトウェアのいくつかについて説明することです。この研究は、遺伝子発現を制御する可能性のある構造多型を調査する前に、DNA、RNA、またはタンパク質配列の機能要素に関する洞察を提供します。また、このレビューでは、プログラム可能なヌクレアーゼベースのゲノム編集技術に使用されるツールについても簡単に説明します。