理論および計算科学ジャーナル
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概要

私たちは自然からどれだけ離れているのか？ ドラッグバンクの記述子とトリペプチド分子の相関類似性の分析

アイトナー K、ガウェダ T、コッホ U

Drug Bank 分子データベースの 2D 位相的記述子と 8,000 個のトリペプチド (核酸によってエンコードされたすべての可能なアミノ酸の組み合わせ) の類似性について統計分析を実行しました。トリペプチド分子の理論的に計算された特性 (MW、AlogP、位相的 PSA、水素結合供与体および水素結合受容体) と Drug Bank の位相的記述子の相関関係は、単純なトリペプチドと研究室で開発された専用の生物活性を持つ化合物との間に大きな類似性を示しました。この論文では、記述子によってエンコードされた同様の分子特性を持つ化合物の数の分布のヒストグラムを示します。統計データとその相関関係の大規模な分析のためのシンプルで革新的な方法論が、私たちの研究で開発されました。いくつかの仮説は、高度に加工された食品が天然の抗菌および抗ウイルスバリアであることを示唆しています。文献データと比較した私たちの研究は、多くの生体異物がトリペプチドである天然代謝物と位相的に類似しており、いくつかは同様の治療用途があることを証明しています。