植物生化学および生理学ジャーナル
オープンアクセス

概要

マウスμオピオイド受容体の結晶構造を用いた精度評価によるヒトμオピオイド受容体モデル

ホセ・マヌエル・ペレス・アギラール、ジェフリー・G・セイブン、レニユ・リウ

ヒト μ オピオイド受容体のモデルは、G タンパク質共役受容体 (GPCR) 構造と相同性 (比較) モデリング技術を使用して構築されました。マウス μ オピオイド受容体に基づく構築物の高解像度結晶構造の最近の発表は、相同性モデルの信頼性を評価し、比較モデルの精度を高めるためにより多くのテンプレート (既知の構造) を導入することの妥当性をテストするユニークな機会を提供します。最初のモデルでは、β ₂アドレナリン受容体とウシロドプシン受容体の 2 つのテンプレートが使用されました。2 番目のモデルでは、β ₂アドレナリン受容体、ウシロドプシン受容体、β ₁アドレナリン受容体、および A _2Aアデノシン受容体の 4 つのテンプレートが使用されました。追加のテンプレートを含めると、同じ配列アライメントを使用した場合の構造モチーフとモデルの他の機能の精度が向上しました。予測された構造は、受容体の活性化に関連付けられている DRY モチーフなどの重要な受容体領域で特に関連性がありました。さらに、この研究では、非常に多様な EC2 ループの例で示されているように、受容体配列の類似性が相同性モデリングにおいて極めて重要であることが示されました。この研究は、GPCR のロドプシン様ファミリークラスのメンバーである μ オピオイド受容体の場合に相同性モデリング技術の信頼性を実証しています。テンプレートを追加することで、モデルの精度が向上しました。モデリングに関する知見は、結晶構造がまだ不明な他の GPCR に重要な意味を持ち、相同性モデリング技術が、実験結果を解釈し、これらの重要な受容体の活性に関する構造に基づく仮説を立てるための高品質の構造モデルを提供できることを示唆しています。