音声学と聴覚学ジャーナル
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概要

免疫情報学 - ペプチド駆動ワクチンとデュベンハーゲ狂犬病ウイルス糖タンパク質 G のin silicoモデリング

サハル・オビ・アブド・アルバギ、オマル・ハシム・アハメド、マナル・アブダラ・グマー、ホビエブ・アリ・アブドエルラフマン、アハメド・ハムディ・アブハラズ、モハメド・A・ハッサン

背景:ドゥヴェナゲ狂犬病ウイルスは、ラブドウイルス科リッサウイルス属に属し、致命的な感染症を引き起こしますが、有効な治療法はなく、現在までに認可された DNA ワクチンやペプチドワクチンはありません。本研究の目的は、ドゥヴェナゲ狂犬病ウイルスのペプチドワクチンを予測することです。
方法と材料:ドゥヴェナゲウイルスの配列は NCBI から選択し、次に IEDB の多くの B 細胞および T 細胞テストにかけ、駆動ペプチドワクチンとして機能する最も有望なペプチドを実現しました。IEDB を使用して選択したペプチドの集団カバレッジ分析を実行し、最後に MHC1 分子との相互作用を視覚化するために相同性モデリングと分子ドッキング研究を行いました。
結果と結論: T 細胞テスト用にテストされたペプチドの中で、この研究では、世界中の人口カバー率 99.36% で 18 個のアレルに結合することに加え、MHC-One および MHC-Two アレルへの強力な指標として結合親和性をすべて消費することを示す興味深い T 細胞エピトープ (YFLIGVSAV) を予測しました。これらの結果は、テストされたペプチドの中で最も低い結合エネルギーで MHC ホモスピン分子との優れた相互作用を示す分子ドッキング研究によってさらに裏付けられました。3
つの B 細胞エピトープ (AHYK、YTIPDKL、および SLHNPYPDSH) のみが、線状で糖タンパク質 G の表面にあり、抗原性であることによって、実行されたすべての B 細胞テストと重複することがわかりました。