人類学

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ISSN: 2332-0915

概要

統合生物学 2016: 折り返しコイル間 DNA - キム・ビョンドン - ソウル国立大学

キム・ビョンドン

フォールドバックインターコイル (FBI) DNA は、完全にユニークで一時的な二重鎖 DNA の構成で、フォールドバックヘッド、インターコイルステム、インターコイル平滑末端、およびヘテロ二重鎖の 4 つの主要部分で構成されています。FBI DNA は、パールミレット mt DNA の特殊な TEM 構成で初めて発見され、DNA の領域充填バージョンを使用して実現可能性がテストされました。FBI DNA は、二重鎖 DNA の 1 つの場所でのフォールドバック曲げを使用して形成され、隣接する反平行二重らせんが各主溝で絡み合ってインターコイルを形成するように誘導します。インターコイル内の繰り返し配列は、4 本鎖の塩基対を形成します。繰り返しの塩基反転により、ヘテロ二重鎖の形成と相同組換えが起こります。この二重らせんから FBI DNA 構造への拡散的変換は、4 つの主要な DNA-DNA 変換、すなわち、直接反復による α 欠失、逆反復による Ω ページ特異的反転、ページ特異的挿入における FBI 末端挿入、および転位における非相同結合停止および穴埋め (EHEJ-GF) の媒介に重要な役割を果たします。最も重要なのは、FBI DNA がヘテロ二重鎖に変換されると、DNA 複製後に娘鎖をパラネミックに分離する強力なメカニズムが提供されることです。このメカニズムは、複製フォークでプレクトネミック二重らせん DNA がほどかれた後に捕捉される可能性があります。

 

文献中の生化学およびバイオインフォマティクスの証拠は、FBI DNA が生物学において必然的に存在し機能していることを裏付けています。まとめると、FBI DNA 構造の動的かつ多様な変化に注目することで、さまざまな DNA の機能、ゲノム段階および細胞分化におけるそれらの相互作用に関する新たな知識が得られる可能性があります。運命研究手法に関する提案も議論されるでしょう。フォールドバック インターコイル (FBI) DNA は、二重鎖 DNA の非らせん状平行配列の 1 つの部分で最大 180° の角度で折り返し、各主溝内で二重らせんが絡み合って直径 2.2 nm のインターコイルを形成することで形成されます。FBI DNA は、欠失および逆位の分子内相同組換えを媒介すると考えられています。一方、ページ特異的挿入と呼ばれる分子間相同組換えは、FBI DNA末端(attPページ)を標的DNA(attBページ)に直接垂直に挿入することで媒介されます。DNAトランスポゾンの転位には、末端逆位反復のペアリングと5~7bpのタンデム標的複製が含まれます。FBI DNA構造は、エンハンサー因子の関与とともに、単純転位と複製転位を効果的に説明します。標的ページ複製メカニズムを使用する多くのレトロトランスポゾンのほとんどは、非相同末端結合とホールフィリングを使用して、ペアになったコイル末端間のFBI DNA媒介垂直挿入に従うことも示唆されています。

 

A genome-extensive angle of transposable factors in mild of FBI DNA is discussed. The transposable detail (TE) became first defined with the aid of using McClintock as a controlling detail that jumps from one role to some other withinside the maize chromosome withinside the mid- 1940s, lengthy earlier than the invention with the aid of using Watson and Crick of the double helix shape of DNA as a genetic detail. It became a time whilst, after the rediscovery of Mendel’s Law of Heredity in 1900, the cytogenetic look at of chromosomes became at the vanguard of genetics and whilst genes have been concept to be beads on a string positioned at the chromosome. It became withinside the overdue Nineteen Seventies and early Eighties whilst insertion series (IS) factors and transposons (Tn) have been observed and observed to be much like McClintock’s controlling factors, and her AC/DS factors have been showed on the DNA series stage as a TE. Salient functions of DNA transposable factors (dTEs), which include terminal inverted repeats (TIRs), goal web page duplication (TSD), the transposase gene, and easy and replicative transposition mechanisms were properly installed with the aid of using great molecular biology and biochemistry studies. Then, unfashionable transposable factors (rTEs), which include lengthy terminal repeat (LTR)-retrotransposons, non- LTR-retrotransposons, and different unfashionable-factors, have been being delivered to the repertoire because the Eighties to make the image numerous and complicated.

 

ポストゲノム時代におけるコンピューターによるスクリーニングによっても、主に真核生物から多くの新しい TE ファミリーが生み出されており、その転位の仕組みとメカニズムに基づいた新しいモデルが必要になっています。フォールドバックインターコイル (FBI) DNA の存在は、1985 年に Kim によって初めて言及され、反転と欠失の分子内相同組換えを媒介する領域充填モデルを使用することで証明されました。1987 年には、FBI DNA が、フォールドバック末端での分子間 DNA 再配置 (ページ固有の挿入を含む) と、無関係な dTE のインターコイル末端での DNA 転位統合を媒介できることも証明されました。この研究では、転位の FBI DNA 媒介が、特別なトレーニングと rTE ファミリーにどのように拡張されるかがテストされます。この評価では、複製の説明を絞り込み、FBI DNA の DNA 転位のメカニズムへの応用に関係するメカニズム機能に注目します。TSD は、dTE と rTE の両方の転位メカニズムの調和の一般的な場所のランドマークとして機能します。これまでのところ、唯一の例外は Helitron スーパーファミリーで、TSD がなく、ローリング サークル複製モデルを採用しています。TE がホスト染色体に組み込まれる時点で TSD が生成されている限り、最初の中間体が RNA または一本鎖 DNA であるかどうかに関係なく、組み込みの直接中間体は二本鎖 DNA 形式であることを示しています。

この研究の一部は、 2016年7月18日から20日にドイツのベルリンで開催された第4国際統合生物学会議で発表されました。

免責事項: この要約は人工知能ツールを使用して翻訳されたものであり、まだレビューまたは検証されていません。
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