アルコール依存症と薬物依存のジャーナル
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概要

文献に基づく遺伝子優先順位付けツール Genie を使用した乳がんの分子プロファイルのメタゲノム解析: 新しいアプローチ

アミット・クマール・ヤダフとヴィディヤ・ジャー

背景:乳がんの生物学的複雑性と異質性は分子プロファイルによって説明できます。マイクロアレイ技術は、これを研究するための最適な方法です。しかし、一定の制限があります。計算技術は、遺伝子発現プロファイルを研究するための新しい方法です。

材料と方法:無料で入手できるウェブベースのソフトウェア Genie を使用して、MEDLINE、NCBI Gene、HomoloGene データベースの文献、遺伝子、相同性情報を分析しました。入力は、対象種 (Homo sapiens) と生物医学トピック (乳がん) でした。入力に応じて、対象種の遺伝子が優先されます。

結果:報告された 1906 個の遺伝子に与えられた順位は予想どおりではありませんでした。そのため、ヒット数に応じて手動で再順位付けされました。これらは 70 個に絞り込まれました。これらの遺伝子によってコード化されたタンパク質とその機能は、NCBI データベースから取得されました。その後、これらの遺伝子は、機能と発癌における役割に基づいて、明確なカテゴリにグループ化されました。

結論:乳がんの分子プロファイルを研究するための新しい計算手法が実証されました。乳がんの遺伝子発現プロファイルを研究するための 70 個の遺伝子のパネルが提案されました。これらの遺伝子は乳がんの分子病因のあらゆる側面を包括的に評価し、将来の臨床研究に推奨されます。