応用微生物学: オープンアクセス
オープンアクセス

ISSN: 2471-9315

概要

廃水ゲノミクスによるアンモニア酸化細菌の微生物多様性の解明

Maulin Pramod Shah and Reddy GV

独立栄養性アンモニア酸化細菌は、産業廃水処理システムにおける微生物群集の重要な要素です。同一の廃水を処理する 2 つの実物大処理リアクター (砂ろ過器と生物学的曝気ろ過器) における β プロテオバクテリア アンモニア酸化細菌の多様性と群集構成を評価しました。アンモニア酸化細菌選択プライマーの 16S rRNA 遺伝子断片のポリメラーゼ連鎖反応を変性勾配ゲル電気泳動と統合し、優勢なアンモニア酸化細菌集団の比較分析を可能にしました。優勢なアンモニア酸化細菌の系統学的類似性は、ポリメラーゼ連鎖反応で増幅された 16S rRNA 遺伝子断片のクローニングと配列決定によって検証されました。変性勾配ゲル電気泳動プロファイルは、確率ベースの類似性指数を使用して評価されました。類似性の確率的指標を利用することで、異なるサンプルのアンモニア酸化細菌群集構造に観察された相違点と類似点が統計的に有意であるか、または異なるアンモニア酸化細菌でのリアクターのランダムなコロニー形成を示唆する変性勾配ゲル電気泳動プロファイルのバンドのランダムな一致で説明できるかを検討できるようになりました。すべての類似配列が認識され、Nitrosomonas 属にグループ化されました。分析したすべてのサンプルの BAF よりも散水フィルターでより多様なアンモニア酸化細菌が検出され、Nitrosococcus mobilis に最も密接に関連するアンモニア酸化細菌が優勢であることが示されました。変性勾配ゲル電気泳動プロファイルの数値調査により、フィルターベッドの深さプロファイルのアンモニア酸化細菌群集がランダムでない方法で選択されたことが示されました。

免責事項: この要約は人工知能ツールを使用して翻訳されたものであり、まだレビューまたは検証されていません。
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