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オープンアクセス

概要

PCR-RFLP を使用した分子タイピングにより、コートジボワール (西アフリカ) のリボリ海岸におけるブルーリ潰瘍の原因となる環境性結核菌の多様性が明らかになりました。

キネ・グレゴワール、カコウ・ンガゾア・E・ソランジュ、アカ・ヌゲッタ、ヴァコウ・サビーヌ、クリバリ・ンゴロ・デヴィッド、コウアコウ・ヘレン、シラ・アブバカール、フェイ＝ケット・オルテンス、アウシ・セルジュ、ドッソ・ミレイユ

ブルーリ潰瘍は、Mycobacterium ulcerans (MU) によって引き起こされる無視されている皮膚疾患で、世界中で、特にアフリカ諸国で毎年 1000 人が罹患しています。ブルーリ潰瘍の根絶は、農村部の流行地域では早期診断が不足しており、国の医療制度ではこの疾患が知られていないため困難です。中央および西アフリカの農村部の湿地帯や沼地では、子供たちが最も影響を受けています。MU は環境性マイコラクトン産生マイコバクテリア (MPM) に属し、循環株の遺伝的多様性が高いです。診断は、培養とポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) によるゲノム検出によって適用されました。PCR は、MU の臨床サンプルと環境サンプルを確認するためのゴールド メソッドになりました。MIRU-VNTR 法と、MIRU-VNTR マーカーと組み合わせた制限酵素断片長多型 (RFLP) は、さまざまな発生源からのマイコバクテリアを識別するために使用されました。本研究の目的は、MIRU-VNTRTypingとRFLPを組み合わせて使用​​し、環境、培養株、臨床サンプルからのさまざまなマイコバクテリア源の分子多様性を調査することです。流行地域から採取した合計26のサンプル（水、堆積物、マイコバクテリア株、スワブ）は、まずIS2404またはZiehl-Neelsen染色によって確認されました。サンプルは、4つの特定のマーカー（MIRU-1、VNTR6、VNTR19、ST-1）についてPCRタイピングによって分析され、アンプリコンはMspI制限エンドヌクレアーゼで消化され、PCR-RFLP分析のために3％アガロースゲル電気泳動によって分離されました。私たちの結果は、VNTR-MIRUタイピングによって異なる増幅を示しました。環境サンプルでは、​​PCR-MIRU-1で25％の低い増幅が検出されました。培養株と臨床サンプルの増幅率はそれぞれ35.7％と62.5％でした。 ST-1 は培養株に対して 71.4% の最も優れた増幅マーカーを示し、臨床サンプルはすべてのマーカーに対して 62.5% の良好な増幅率を示した。臨床サンプルの PCR-RFLP プロファイルは同一であったが、環境株とマイコバクテリア株は異なる PCR-RFLP プロファイルを示した。我々は、環境スクリーニングのために流行国における非結核性マイコバクテリアの遺伝子型を確認するための、PCR-RFLP 感度が高く、より簡単で安価な手法を開発した。我々は、VNTR-MIRU 配列の反復遺伝子座の変異と、マイコバクテリアが環境からヒトに適応したことを示唆している。この研究は、コートジボワールにおけるマイコバクテリアのいくつかの遺伝子型の循環を確認した。