アルコール依存症と薬物依存のジャーナル
オープンアクセス

概要

免疫情報学アプローチを用いたスーダンエボラウイルスに対するマルチエピトープペプチドワクチンの予測

アーメド・ハムディ・アブハラズ*、クビブ・アリ・アブドエラマン、モジャヒド・サラー・イブラヒム、ワリード・ハッサン・フシアン、モハメド・シディグ・モハメド、マルワン・ムスタファ・バダウィ、モハメド・アハメド・サリフ

スーダンエボラウイルスは、出血熱を引き起こすフィロウイルス科に属する一本鎖マイナス鎖RNAゲノムです。治療法もワクチンもないため、本研究では、免疫情報科学のアプローチを使用してSUDVの全株の糖タンパク質を分析し、保存領域を特定してペプチドワクチンを設計し、ペプチドワクチンとして使用できる可能性のあるすべてのエピトープを予測することを目的とします。NCBIデータベースから取得した合計21のスーダンエボラウイルス糖タンパク質をアラインメントして保存性を決定し、IEDB分析リソースを使用してエピトープを予測しました。B細胞用ペプチドワクチンとして予測されたエピトープは3つあります（PPPPDGVR、ETFLQSPP、LQSPPIRE）。 T 細胞については、4 つのエピトープが MHC クラス I に対して高い親和性を示し (FLYDRLAST、IIIAIIALL、MHNQNALVC、RTYTILNRK)、スーダンおよび全世界の人口に対して高いカバー率を示しました。また、MHC クラス II では、最も頻繁に使用される MHC クラス II アレルと相互作用する 4 つのエピトープ (FAEGVIAFL、FLRATTELR、FLYDRLAST、FVWVIILFQ) がスーダンおよび全世界の人口に対して高いカバー率を示しました。これらの予測エピトープのペプチドワクチンとしての有効性を証明するために、in vivo および in vitro 研究を推奨します。