音声学と聴覚学ジャーナル
オープンアクセス

概要

多能性因子PBX1は関節リウマチの治療効果を予測する

Karin ME Andersson1 、 Eric Malmhäll-Bah1 、 Nina Y.Oparina1 、 Weiyang Tao1 、 Aridaman Pandit2 、 Malin C. Erlandsson1,3、 Venkataragavan Chandrasekaran1 、 Sofia T. Silfverswärd1 、 Rille Pullerits1,3,4、 Maria I. Bokarewa1,3*

目的:幹細胞の多能性を維持する転写因子である PBX1 が抗リウマチ治療への反応を予測するかどうかを調べることで、関節リウマチ (RA) における T 細胞再構成の背後にある分子メカニズムを研究します。

方法:疾患活動性の低い RA 患者 87 名と疾患活動性の高い RA 患者 78 名のCD4 ^{+ T 細胞で RNA シーケンシングによる全ゲノムトランスクリプトミクスを実施しました。PBX1 hi}および PBX1 ^{loグループの治療結果を比較しました。PBX1 関連表現型および生物学的プロセスは、PBX1 hi} CD4 ⁺細胞で差次的に発現する遺伝子のクラスター化によって特定されました。胸腺の PBX1 ^hiクラスターは、単一細胞ベースの解析によって特定されました。DEG 間の PBX1 転写ターゲットは、DNA モチーフ、クロマチン免疫沈降シーケンシング、およびオープンクロマチンデータの統合解析によって予測されました。

結果： PBX1 ^hi CD4 ⁺細胞は多能性の刻印された特徴を持ち、サイトカイン産生を欠いていました。活動性RAでは、PBX1 ^hi細胞はCD34 ⁺胸腺前駆リンパ球で濃縮されていました。PBX1 ^{hi患者はPBX1 lo}と比較して、抗TNF治療でDAS28の減少がより良好で、非反応者の頻度が低かった（両方ともp = 0.026）。非活動性RAでは、PBX1 ^hi細胞はCD62L / SELLおよびCD31 / PECAM1を発現する胸腺後ナイーブT細胞で濃縮されていました。ここで、PBX1 ^{hi患者はPBX1 lo}患者と比較して寛解に達するのに少ない治療を必要としました（p = 0.011）。胸腺では、CD34およびPECAM1はPBX1 ^hiクラスター内に注釈されていました。統合解析により、中枢 T 細胞成熟遺伝子 TBX21、PRDM1、BATF3、KLF1 が転写的に PBX1 に依存していることが明らかになりました。

結論:この研究は、PBX1 の濃縮が CD4 ⁺細胞の多能性表現型と関連しており、RA における治療反応に有利であることを示しています。