抗ウイルス薬および抗レトロウイルス薬ジャーナル
オープンアクセス

概要

ムンバイの患者コホートにおける HIV-1 サブタイプ C 逆転写酵素およびプロテアーゼ遺伝子の多型

リトウィック・ダハーケ、シュラッダ・メータ、スネハ・ヤダブ、アバイ・チョーダリー、ランジャナ・A・デシュムク

目的:先進国は、HIV-1 の一次/伝播薬剤耐性率に警戒感を抱いています。コンセンサス サブタイプ B 配列に関連する HIV-1 サブタイプ C 変異の特定の多型が一次耐性と関連し、時には一次耐性と誤解されるという妥当性については議論があります。この予備研究では、インドのムンバイの患者コホートから HIV-1 サブタイプ C の逆転写酵素 (RT) およびプロテアーゼ (PR) 遺伝子の多型を特定しました。

方法:この研究は、24 人の患者 (抗レトロウイルス療法経験者と薬物未経験者) の血漿サンプルを使用して、自家製のセミネスト逆転写酵素 PCR 法とそれに続く配列決定および配列分析を使用して実施されました。多型およびその他の薬物耐性変異の分析と解釈には、スタンフォード HIV 薬剤耐性データベースを使用しました。また、PR遺伝子の監視薬剤耐性変異 (SDRM) も分析しました。

結果: PR 遺伝子で 0.1337 ± 0.042、RT 遺伝子で 0.067 ± 0.014 の変異頻度で多型が判定され、PR 遺伝子と RT 遺伝子でそれぞれ 16.6% と 12.5% のサンプルに薬剤耐性変異が認められました。50% を超える置換は、PR 遺伝子では L19、V82、M36、R41、L63、H69、L89、I93、RT 遺伝子では D121、K122、T165、K166、K173、D177、T200、Q207、R211 の位置で発生しました。さらに、PR 遺伝子の SDRM は 15.0% のサンプルで観察されました。

結論: 我々の調査結果は、インドの HIV-1 サブタイプ C に多型が存在するという以前の調査結果と一致しており、これらの多型には耐性に関連する多数の主要な変異とマイナー/アクセサリ変異も含まれる可能性があることを再確認しています。オンラインで利用できる薬剤耐性データベースのほとんどはサブタイプ B に基づいています。したがって、特にプロテアーゼ阻害剤を併用する抗レトロウイルス療法を開始する前に、薬剤耐性の定期的かつ明確な監視を強化するために、HIV サブタイプ固有の薬剤耐性データベースを作成することを推奨します。