トランスクリプトミクス: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

Clivia miniata におけるカルコン合成酵素 (CHS) およびアントシアニジン合成酵素 (ANS) 遺伝子の描写と発現解析

ミーロウAW

カルコン合成酵素 (CHS) とアントシアニジン合成酵素 (ANS) は、
植物におけるアントシアニンの生成を担う主要なタンパク質の 1 つです。これらは通常、複数の遺伝子ファミリーによってコード化されており、
これらのファミリーの特定の個体は色素沈着に関与しています。この研究では、
開花組織が色の変化を経験する Clivia miniata の CHS 遺伝子と ANS 遺伝子を調べました。植物
組織から RNA から cDNA を抽出し、まず、複雑なシーケンシング手法を使用して、短いシーケンス長の 3 つのユニジーン (CmiCHS 11996、CmiCHS 43839、および CmiANS) を取得しました。品質に関する具体的な研究は、未発表のCHS および ANS の短いシーケンス
から計画されました。
PCR後の増幅cDNAの長さは、CmiCHS 11996
（933 bp）、CmiCHS 43839（951 bp）、CmiANS（983 bp）でした。最初に、
CHSタンパク質の390アミノ酸残基に基づくタンパク質（AEN04070）の予想されるタンパク質
とANSタンパク質（AGD99672）の予想されるタンパク質を比較してORF構造を解析しました。コンピューターによる解析により、
決定された分子量と仮想等電点（pI）CmiCHS 11996とCmiCHS43839は
それぞれ31.0 kDa - 6.95と34.6 kDa - 7.54であることが明らかになりました。物質制限部位と活性部位の重要な部分は、
推定されたアミノ酸配列から簡単に特定されました。異なる分類体系では
、CmiCHS および CmiANS 系統が非常によく保存されており、
他の植物のカルコン合成酵素と高い分類特性 (>83%) を共有していることが示されました。ただし、連続定量 PCR を
使用して、さまざまな組織や花被片 (オレンジ色と黄色の花) におけるこれらの特性の発現プロファイルを決定する別の調査が行われました。CmiCHS および CmiANS の発現レベルは、他の組織 (葉、花茎、花被) と比較して花被片で高くなりました。これらの発現は、アントシアニンの蓄積と比較した組織における特性を示しており、オレンジ色と黄色の色がカルコン合成酵素およびアントシアニン合成酵素の規則と明確に一致していることを示唆しています。