アヌラグ・アナンド
ハイスループットシーケンス研究と新しいソフトウェアツールは、微生物群集の分析に革命をもたらしていますが、実験方法と計算方法が多岐にわたるため、困難な場合があります。このレビューでは、コミュニティプロファイリングへのさまざまなアプローチのいくつかについて説明し、さまざまな実験アプローチ、シーケンス方法、分析方法の長所と短所を強調します。また、さまざまなヒトマイクロバイオームプロジェクトから浮かび上がった重要な疑問の1つである、「私たち全員が共有する豊富な生物または系統の実質的なコアはあるのでしょうか?」についても取り上げます。手や腸など、人間の体の生息地の一部では、個体間の多様性が非常に大きいため、すべての個体で特定の種が多く存在する可能性を排除できるようです。代わりに、より高次の分類群または機能的な遺伝子に焦点を当てる必要がある可能性があります。