化学療法: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

膀胱癌の腫瘍微小環境における免疫細胞浸潤に関連するMMP9の予後マーカー

Han-Sheng Lin、Wan-Wan Liu、Neng-Zhuo Feng、Shuang-Zhong、Shang-Jin Chen、Jing-Wei He*、Jian Liang*

背景:膀胱がん (BLCA) は最も一般的なヒトのがんの 1 つで、その発症率は特に女性で増加しています。腫瘍微小環境 (TME) は腫瘍の発生と進行に重要な役割を果たします。私たちは、Cancer Genome Atlas Program データベースで BLCA の発現プロファイルを調査し、腫瘍微小環境 (TME) の構成に影響を与える可能性のある遺伝子を調べました。次に、遺伝子と腫瘍の予後との関係を分析し、BLCA の診断と治療の新しいスタイルにつながる可能性のある免疫予後マーカーを探しました。

方法:癌ゲノムアトラス (TCGA) から BLCA の RNA-seq データを入手し、悪性組織における間質細胞と免疫細胞の発現推定 (ESTIMATE) データ アルゴリズムを使用して免疫および間質スコアを計算しました。差次的に発現した遺伝子は COX 回帰分析で実行され、タンパク質間相互作用 (PPI) ネットワークの構築に使用されました。

結果：交差解析により、マトリックスメタロプロテアーゼ9（MMP9）が唯一の交差遺伝子であることが実証されました。RNA転写産物の相対サブセットの推定による細胞型同定（CIBERSORT）アルゴリズムを使用して、BLCAにおける腫瘍浸潤免疫細胞（TIC）の割合を計算しました。TICにおけるMMP9の高発現グループと低発現グループの違いが確立されました。次に、各種TICにおけるMMP9の発現レベルが相関しました。生存、臨床、およびエンリッチメント解析により、 MMP9はBLCAの免疫予後因子であり、腫瘍微小環境で重要な役割を果たすことがわかりました。最終的に、 MMP9と免疫チェックポイント遺伝子との相関解析により、 MMP9はBLCAに対する免疫療法の効果を予測できることが示されました。

結論: MMP9 は免疫予後マーカー遺伝子です。MMP9は複数の経路を通じて BLCA の免疫プロセスの調節に関与しており、PD-1 および CTLA4 免疫標的と密接に関連しています。MMP9 の発現はBLCAの予後に影響を及ぼす可能性があり、BLCA の予後関連マーカーである可能性を示しています。