Chen-Yi Chang1 、 Su-xian Zeng2 、 Yuan-Ding Ma1 、 Jun-Wen Zheng1 、 Xin Li1 、 Chen-Yong Xiong1 、 Hon-Jin Zhou1 、 Chun-Tao Wei1 、 Zong-Qiang Li1 、
ランドレース豚と徳宝豚の表現型の違い、特に代謝と筋肉の成長の違いに影響を与える重要な遺伝子を特定する。ランドレース豚と徳宝豚の大腰筋の差次的発現遺伝子は、mRNAトランスクリプトームシークエンシングによって検出された。ランドレース豚と徳宝豚の大腰筋の全RNAを抽出し、mRNAを精製し、cDNAライブラリーを構築し、トランスクリプトームシークエンシングを行い、その後、シークエンシング品質評価を行うことで、本研究のシークエンシング品質が比較的高いことがわかった。すべてのサンプルで合計17,943個の遺伝子が検出され、そのうち17,870個の既知遺伝子と73個の新規遺伝子が含まれていた。|log2FC|が2より大きく、Q値が0.001未満の遺伝子を定義し、有意に差次的発現遺伝子として選別した。ランドレース豚と徳宝豚のサンプルから合計1661個の差次的発現遺伝子がスクリーニングされ、そのうち1255個の遺伝子が差次的に上方制御され、406個の遺伝子が差次的に下方制御されました。差次的遺伝子分析を通じて、これらの遺伝子は主に代謝調節、筋肉と脂肪の発達などのプロセスに関与しており、特にMAPK14、FOS、SIRT1、KRAS、EGR1、CDNNB1などのいくつかの重要な機能遺伝子が関与していると結論付けられました。要約すると、本研究ではトランスクリプトームシークエンシング法を使用し、データ分析を通じてランドレース豚と徳宝豚の間で差次的に発現する遺伝子を選択し、最終的に表現型の違いに影響を与える重要な遺伝子をスクリーニングし、将来的により良い品種を育種するための遺伝的サポートを提供しました。