アルコール依存症と薬物依存のジャーナル
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概要

神経膠芽腫癌幹細胞株の単一細胞RNA配列解析により、染色体の不安定性が細胞外マトリックス組織の乱れにつながることが明らかになった

ルトヴィ・ヴァヤ

2016年世界保健機関（WHO）の中枢神経系（CNS）がんの新しい分類によると、多形性神経膠芽腫（GBM）はCNSの最も頻度の高い悪性腫瘍です。GBMには幅広い遺伝的およびエピジェネティックな変化が含まれており、多数の変異サブグループが生じており、その一部は独立した患者の生存と治療反応に役割を果たすことが示されています。GBM治療の進歩にもかかわらず、これらの腫瘍と診断された患者は、病気が進行するにつれて予後が悪く、生活の質が低下することがよくあります。神経膠腫がん幹細胞のシングルセルRNAハイスループットシーケンシング処理データはGEO-NCBIから取得され、単一の神経膠腫神経幹細胞（GSC）と正常神経幹細胞（NSC）の根本的な発現の違いを明らかにするために分析されました。 NCBIバイオプロジェクト（PRJNA546254）から得られた75のGSCと59のNSCからなる134のサンプルの転写プロファイルに対してバイオインフォマティクス解析を実施しました。探索的解析を実施したところ、GBM腫瘍と正常幹細胞の間で有意な遺伝子発現変動パターンが示されました。続いて、Deseq2差動遺伝子発現解析により、GSCとNSCの間で383の差動発現遺伝子が特定されました[padj.値<0.05、log2倍変化（> = +/- 1.5）]。この研究では、神経膠腫における細胞外マトリックス組織化および細胞外構造組織化経路の乱れたプロセスに寄与する主要な特徴として、LOX、LOX1、COL6A2、COL8A1、COL3A1、LUM、TGFB1、LAMA2、POSTN、MFAP5、MFAP2、FBN2、FLRT2、HTRA1などの遺伝子が明らかになりました。結論として、ここで提示された結果は、GBM の進行に関する新たな知見と神経膠腫形成に関与する新規遺伝子の特定を明らかにしており、治療目標の達成に向けてさらに調査を進めることができる可能性があります。