小児研究の進歩
オープンアクセス

概要

ノロウイルス GII.4 変異体の時空間進化ダイナミクス

ルタ・クルカルニ、アトゥル・M・ワリンベ、ショバ・D・チタンバル

背景: ノロウイルス (NoV) は、世界中で散発性の小児胃腸炎の 2 番目に多い原因です。GII.4 遺伝子型のノロウイルスは世界的に優勢であり、主要なカプシドタンパク質をコードする VP1 遺伝子で継続的な進化を遂げ、その結果、新しい変異体が出現し、現在までに 14 の GII.4 変異体が特定されています。方法: 本研究では、ベイズ法、系統地理学、および各 GII.4 変異体を表す完全な VP1 配列のデータセットの移動パターン解析を使用して、世界的に循環している GII.4 NoV の時空間進化ダイナミクスを調査しました。結果: GII.4 VP1 の推定平均進化率は、サイトあたり年間 (サブ/サイト/年) あたり 5.1 x 10-3 ヌクレオチド置換であり、最近の共通祖先 (tMRCA) までの時間はおよそ 1971 年で、最も可能性の高い祖先の位置はアメリカ合衆国 (USA) でした。 14 の既知の GII.4 変異体は、さまざまな進化速度 (4.5～7.4x10-3 サブ/サイト/年) と tMRCA (約 1984 年から約 2006 年) を示しており、その大半は米国/アジアを祖先とするものでした。移動パターン分析により、オーストラリア、ニュージーランド、インド、南ヨーロッパが GII.4 ノロウイルスの世界的な拡散に重要な役割を果たしていることが示されました。結論: この研究は、GII.4 ノロウイルスの進化ダイナミクスの理解に貢献します。