抗ウイルス薬および抗レトロウイルス薬ジャーナル
オープンアクセス

概要

水疱性口内炎ウイルス糖タンパク質を抗ウイルス薬の標的とし、ダンシルカダベリンとのドッキング

アルピタ・バナジーとサラ・S・チェリアン

ラブドウイルスには、水疱性口内炎ウイルス (VSV) や、狂犬病ウイルス、チャンディプラウイルスなどの有名なヒト病原体が含まれます。標的受容体のモデリングと結合部位の特定は、新しい治療薬の開発における重要なステップです。膜融合経路のタンパク質に選択的に結合するリガンドは、ウイルスの侵入を遅らせたり、ブロックしたりできます。この研究では、VSV の表面糖タンパク質 G が潜在的な抗ウイルス標的として選択されました。ダンシルカダベリン、リマンタジン、アマンタジンは、VSV の内部化を防ぐことが示されている既知の阻害剤ですが、それらの阻害の分子メカニズムは十分に理解されていません。これらのリガンドの融合阻害剤としての可能性は、in silico 結合部位の特定とドッキング研究を行うことで調査されました。G 三量体インターフェースにリガンド結合ポケットが予測されました。ドッキング時に、ダンシルカダベリンはタンパク質を融合活性型に構造転換するために必要な残基領域とエネルギー的に有利な接触を行ったが、リマンタジンとアマンタジンは結合ポケットにドッキングできなかった。私たちの結果は、ダンシルカダベリンが融合前の構造で G タンパク質を安定化させることでウイルスの侵入を防ぐことができることを示唆している。この研究の知見は、同じファミリーの他のウイルスに対する抗ウイルス剤の設計に応用できる可能性がある。