人類学
オープンアクセス

概要

定量的リアルタイムPCRを用いたVaccinium bracteatum Thunbの果実発育における遺伝子発現解析のための参照遺伝子の検証

Feng He*、Liangxian Gui、Yan Zhang、Bo Zhu、Xiaoping Zhang、Min Shen、Fengying Wan、Lu Yang、Jiaxin Xiao*

背景：Vaccinium bracteatum Thunb.（VBT）は、中国東部および南部の山岳地帯に広く分布しています。VBTの葉は医学的価値が高く、米を染めて「五味飯」を作るのに使用できます。その果実にも豊富な栄養素が含まれています。しかし、VBTの分子含有量の調査には注目が集まっていません。以前、私たちはさまざまな成熟段階にある3つの典型的なVBT果実に対してRNA-seqを実行しましたが、信頼できる参照遺伝子が検証中に失われました。

結果：本研究では、これまでの研究とトランスクリプトミクス解析に基づいて、10 個の候補参照遺伝子を選択しました。その後、これらの遺伝子は、geNorm、NormFinder、Bestkeeper などの方法を組み合わせて総合的なランキング評価を行い、評価されました。その結果、actin2、NADH、ADK 遺伝子は、果実の発達に関与する遺伝子の発現レベルを解析する上で高い信頼性があることがわかりました。さらに、トランスクリプトミクス解析からの 15 個の DEG の転写レベルは、NADH を参照遺伝子として評価され、RT-qPCR データはトランスクリプトミクス データと高い一貫性を示しました。

結論:これらの結果は、遺伝子発現をさらに研究するための信頼できる参照遺伝子を提供し、VBT を包括的に調査するのに役立つでしょう。