感染症と予防医学ジャーナル
オープンアクセス

概要

メキシコ、ケレタロにおける人獣共通結核検出のための全ゲノム配列解析

クラウディア・アンジェリカ・ペレア・ラソ、フェリシアーノ・ミリアン・スアソ、イザベル・バルセナス・レイエス、スサナ・ソーサ・ガレゴス、エルバ・ロドリゲス・ヘルナンデス、スサナ・フローレス・ビジャルバ、ジェルミナル・ホルヘ・カント・アラルコン

研究には、メキシコのケレタロで結核が疑われる患者 1,154 人から採取された痰、尿、その他の体液の合計 2,736 サンプルが含まれていました。すべてのサンプルで抗酸菌染色と選択培地である Stonebrink および Lowenstein-Jensen での培養が行われました。分離株の遺伝子型判定は、スポリゴタイピングと一塩基多型 (SNP) 全ゲノム配列決定によって行われました。得られたMycobacterium bovis スポリゴタイプと SNP タイプは、データベースで見つかった牛のものと比較されました。培養によってMycobacteriumの分離株 21 株 (1.8%) が得られ、すべて痰から得られました。2 株 (13%) はスポリゴタイピングによってM. bovisと同定され、SB0673 と SB0971 はメキシコの牛で頻繁に見つかります。分離株のうち15株の全ゲノム配列が解析され、そのうち2株がM. bovisであることが確認された。ヒトから分離された2株のM. bovisのSNPパターンは、メキシコのさまざまな地域の牛で見つかったものと類似していた。