医薬品設計: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

バイオインフォマティクス解析: キノームツリーの枝におけるタンパク質キナーゼをポールとするリガンドの化学感受性と 2D 構造特性の存在

デビッド・G・コベル

リガンドのタンパク質データバンク (PDB) 構造フラグメントをタンパク質キナーゼ (PK) の ChEMBL IC ₅₀生物活性にリンクするためのバイオインフォマティクス戦略が提案。キノームツリーの別のブランチにあるPKを考えるリガンドが豊富なフラグメントのセットを組み立て、統計的に評価しました。リガンドの 84% の正しい予測を返すことが分かりました。自己組織化マップを使って、6 つの断片の集中予測と、個別に ChEMBL IC 50 データをクラスター化、分割選択の断片メントと分割_化学選択分割選択のフラグメントを持つ分割化学のリガンドの共起に基づく分割表 (Fisher の独立性の検定正確に使用) では、分割化学選択のリガンドの平均回復率はこれらの症例の 7% は、PDB リガンドと完全に構造定め致しております、その中には 8 つの米国食品医薬品局 (FDA) これらのFDAリドの豊富な分岐選択的断片の結合部位分析により、主要な疎水性および非疎水性相互作用の役割が発見されました。に拡張すると、豊富な分岐選択的断片を持つが結晶構造データがない 402 の分岐化学選択的リガンドのサブセットが、PK を選択的に見る候補として発見されました。キノーム分裂でPKを目標とするリガンドを発見することを目的とした化学ライブラリの断片選択による継続的な使用を拡張します。