医薬品設計: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

分子動力学によるトリペプチド構造の配座探索：L,L-Gly-Phe-Phe、L,L-Phe-Gly-Phe、およびL,L-Phe-Phe-Glyの研究

Khebichat N、Nekkaz K、Ghalem S、Sajid Rashid、

天然オリゴペプチドは 2 ～ 50 個のアミノ酸残基から構成され、ほぼすべての生物に存在します。
これらのペプチドのいくつかの機能はわかっていますが、そのメカニズムの正確な性質は、立体構造と構造の詳細を分析することによって特定する必要があります。本研究では、分子動力学 (MD) シミュレーションを使用して立体構造解析を行い、明示的な水モデルにおける 3 つのトリペプチド、L,LGly-Phe-Phe (市販)、L,L-Phe-Gly-Phe、および L,L-Phe-Phe-Gly の動的挙動を調査しました。