医薬品設計: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

サルモネラ・エンテリカに対するリボスイッチのインシリコ予測と阻害剤の設計

メダ・パンディとカマル・ラージ・パルダサニ

Salmonella enterica はチフス熱やいくつかの胃腸感染症の原因となる病原菌です。抗生物質はチフス熱や S. enterica が原因となるその他の感染症の治療に使用されています。抗生物質は基本的に相同タンパク質を標的とし、これらの細菌種は突然変異を起こし、特定の抗生物質に対する耐性を獲得します。また、抗生物質にはいくつかの副作用があります。したがって、抗生物質の問題や副作用に対処するために、新しい薬物標的を探索する必要があります。本論文では、S. enterica の潜在的な薬物標的としてリボスイッチを探索する試みがなされました。リボスイッチは、突然変異が非常にまれな 5' UTR にあります。また、リボスイッチの突然変異は生物自体に有害である可能性があることが報告されています。S. enterica のリボスイッチを予測し、その阻害剤を設計するために、in silico アプローチが提案され、採用されました。RibEx を使用して 7 つのリボスイッチが予測され、そのうちの 1 つがこの調査で取り上げられ、iFoldRNA を使用して構造が予測されました。ブラインドドッキングとフォーカスドッキングを実施し、アラニンをリガンドとして特定しました。次に、ADMET プロファイリング研究と Lipinski の 5 の法則に基づいて、薬物類似分子のライブラリに対して仮想スクリーニングを実施し、12 個のリード分子が阻害剤として特定されました。これらの阻害剤は副作用が非常に少ないです。したがって、リボスイッチは S. enterica によって引き起こされる感染症の治療の代替薬物ターゲットとして使用でき、薬剤耐性と副作用の問題に対処できると結論付けることができます。