医薬品設計: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

COVID-19に対する阻害剤の設計と開発のためのin silico研究

アクシャタ R. パヘルカー、プリタム V. バグウェ、クシュブー マウリヤ、ニキル R. パヘルカー、シュリーラン V. ジョシ、ヴィカス N. テルヴェカール

目的： WHOが宣言したCOVID-19パンデミックは、中国湖北省武漢で最初の症例が報告されました。感染は現在広範囲に広がっており、2020年3月30日の時点で^、世界中で693,224件の感染例と33,106人の死亡が報告されています。これは公衆衛生に関連する国際的な懸念です。危機の真っ只中、世界中でいくつかの研究調査が行われています。ワクチン開発、薬物の再利用、新しい化学物質の開発に関するさまざまな治療と予防の仮説が調査中です。COVID-19は、ベータ属のコロナウイルスファミリーのウイルスです。以前に報告されたSARS-CoVとの類似性があります。私たちは、COVID-19に対するペプチド由来の特異的阻害剤を設計するための足場を提案する予定です。

方法:私たちの戦略は、SARS-CoV-2 の RBM と相互作用し、細胞内への侵入を阻害するペプチド阻害剤を設計することです。コンピューター支援による薬物設計は、より短い時間で生産性を達成するのに役立つ利用可能なツールの 1 つです。私たちは、オンライン ペプチド設計プラットフォームである rosetta、コンピューター支援による薬物設計ソフトウェアである Autodock Vena (Nikhil Pahelkar 氏にライセンス供与)、および Schrodinger の Drug Discovery Suite (ムンバイの ICT にライセンス供与) を利用しました。

結果: SARS-CoV-2 の RBM と強く相互作用するヒト ACE2 の配列に基づいたペプチドを提案します。興味のある読者は、この配列を利用してペプチド配列をさらに改変し、ペプチド模倣体に変換することができます。