酵素工学
オープンアクセス

概要

分子ドッキング、ダイナミクスシミュレーション、リガンドベースの仮説アプローチによる新規オーロラキナーゼ阻害剤の同定のためのin silicoスクリーニング

シドラ・バトゥール、サバ・フェルドゥス、モハマド・A・カマル、ヒラ・イフティカール、サジッド・ラシッド*

オーロラキナーゼファミリーのメンバーは、中心体分離、細胞質分裂、動原体形成、紡錘体組み立て、染色体分離、微小管ダイナミクスなど、さまざまな細胞周期イベントに関与しています。通常、オーロラタンパク質の機能不全は異数性、細胞死、有糸分裂停止を伴い、腫瘍形成につながります。このため、オーロラタンパク質の薬理学的に活性な小分子阻害剤の特定に大きな関心が寄せられています。本研究では、仮想スクリーニングとドッキング解析により、4 つの新規阻害剤を単離しました。その後、これらのヒットは分子動力学シミュレーションによって特性評価され、ATP 結合部位での結合安定性が監視されました。オーロラキナーゼに対する新規でより強力な阻害剤の特性評価を支援するために、リガンドベースのファーマコフォアモデリングアプローチによって、リガンドデータセットの選択的特徴を調査しました。次に、プリンストンおよび Uorsy データベースから単離されたライブラリの仮想スクリーニングを実行するために、最適なファーマコフォアモデルを使用しました。共通のファーマコフォア特性、リピンスキーの 5 つのルール、吸収、分布、代謝、および排泄特性に基づいて、ヒットが絞り込まれ、分子ドッキングによって精製されました。最後に、選択された化合物は、結合能力、コンセンサス スコアリング、および活性値に基づいて検証されました。この研究で説明されている新しい阻害剤は、将来抗癌剤として役立つ可能性のある臨床研究の活性リードを設計するための特性評価に値する可能性があると私たちは考えています。