医薬品設計: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

アルファルファモザイクウイルス（AMV）のコートタンパク質のペプチド断片の表面アクセシビリティに関する物理化学的および免疫化学的レベルにおける情報

ごませVSとケールKV

アルファルファモザイクウイルス (AMV) は、70 科 (実験宿主および自然宿主) の 600 種を超える植物に感染します。コートタンパク質は、生理化学的および免疫化学的レベルで生物活性ペプチドとの構造と機能の相関関係を作成するための重要な材料であり、タンパク質分子の進化的変化を観察するための優れたモデルでもあります。アルファルファモザイクウイルスコートタンパク質の位置 1-MSSSQKKAGGKAGKPTKRSQN-21、151-PTHAGMQNQNF-161、22-YAALRKAQLPKPPALKVPVVKPT-44 の抗原ペプチドは、単一のエピトープで大規模な集団で免疫応答を生成できるため、サブユニットワクチンの開発に最適です。この研究では、MHC クラス I および II 結合ペプチド、抗原性、溶媒アクセシビリティ、極性および非極性残基の予測に PSSM および SVM アルゴリズムを使用し、潜在的な抗原性を持つタンパク質の表面に露出している可能性のある領域を分析して、潜在的な薬物ターゲットが感染に対する活性部位を特定し、合成ペプチドワクチンを設計できるようにします。