医薬品設計: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

WEBINA 1.0.3 を使用した合成トリペプチド誘導体の分子ドッキング

R. ゴビンダラジャン 1、ヴィサラプ ナーガ ラクシュミ 2*

インシリコ法は、創薬分野で非常に重要な役割を担っています。分子ドッキングは、小分子の結合モードと親和性をその標的分子 (通常はタンパク質) に対して予測するために広く使用されている計算手法です。分子ドッキングは、コンピューターの能力の劇的な向上と、小分子およびタンパク質データベースの利用可能性の拡大によって大幅に促進されました。Webina は、分子ドッキング用の人気のソフトウェアである Autodock Vina を完全に Web ブラウザーで実行する JavaScript/Web アセンブリ ライブラリです。ドッキング計算は、リモート サーバーではなく、ユーザー自身のコンピューターで行われます。Webina Web アプリには便利なインターフェイスが含まれているため、ユーザーは簡単にドッキング ランを設定し、結果を分析できます。アプリの実行バージョンは無料でアクセスできます。Webina Web サーバーを使用して、4FGW タンパク質との分子ドッキング研究のために、合計 18 の合成ペプチド誘導体が完了しました。A2、A3、B1、B2、および B3 は良好な活性を示しました。