医薬品設計: オープンアクセス
オープンアクセス

概要

ToxDelta: 相違が化学物質の効果にどのように影響するかを評価する新しいプログラム

アザディ・ゴルバマキ、アレッシオ・M・フランキ、セレナ・マンガネッリ、アルベルト・マンガナーロ、ジュゼッピーナ・ジーニ、エミリオ・ベンフェナティ

ToxDelta は、fmcs_R パッケージの修正版に基づく、化学物質の毒性を評価するための新しいツールです。構造的に類似した 2 つの分子は、最大共通部分構造 (MCS) を共有しています。2 つの類似分子が異なる効果を持つかどうかを評価するために、MCS に含まれない分子フラグメントに注目しました。これらの部分は、プロパティの値を増減させる可能性があります。私たちは、分子のリングが壊れてはならない毒性評価における効率的な関連性の MCS 概念のバリエーションを検討しました。対象化学物質の毒性を評価するために、ToxDelta は MCS を抽出し、残りのフラグメントを描写します。これらの各部分は 2 つの分子間の違いを表し、毒性評価における関連性は、アクティブなフラグメントと非アクティブなフラグメントの知識ベースのリストに対して評価されます。ToxDelta は、リード アクロス アプローチで分子の相違点を考慮します。