農薬生化学では、殺虫剤、殺菌剤、除草剤、非致死性害虫駆除剤、フェロモンの生合成、ホルモン、植物抵抗性薬剤などの類似化合物などの植物保護剤の作用機序を扱います。主に、比較毒性の生化学と生理学、作用機序、病態生理学、植物成長調節因子、耐性、寄生虫と宿主の両方に対する農薬のその他の影響に重点を置いています。